File Coverage

blib/lib/CracTools/Const.pm
Criterion Covered Total %
statement 6 6 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 2 2 100.0
pod n/a
total 8 8 100.0


line stmt bran cond sub pod time code
1             ###############################################################################
2             # #
3             # Copyright © 2012-2013 -- IRB/INSERM #
4             # (Institut de Recherche en Biothérapie / #
5             # Institut National de la Santé et de la #
6             # Recherche Médicale) #
7             # #
8             # Auteurs/Authors: Jerôme AUDOUX #
9             # Nicolas PHILIPPE #
10             # #
11             # ------------------------------------------------------------------------- #
12             # #
13             # Ce fichier fait partie de la suite CracTools qui contient plusieurs pipeline#
14             # intégrés permettant de traiter les évênements biologiques présents dans du #
15             # RNA-Seq. Les CracTools travaillent à partir d'un fichier SAM de CRAC et d'un#
16             # fichier d'annotation au format GFF3. #
17             # #
18             # Ce logiciel est régi par la licence CeCILL soumise au droit français et #
19             # respectant les principes de diffusion des logiciels libres. Vous pouvez #
20             # utiliser, modifier et/ou redistribuer ce programme sous les conditions de #
21             # la licence CeCILL telle que diffusée par le CEA, le CNRS et l'INRIA sur #
22             # le site "http://www.cecill.info". #
23             # #
24             # En contrepartie de l'accessibilité au code source et des droits de copie, #
25             # de modification et de redistribution accordés par cette licence, il n'est #
26             # offert aux utilisateurs qu'une garantie limitée. Pour les mêmes raisons, #
27             # seule une responsabilité restreinte pèse sur l'auteur du programme, le #
28             # titulaire des droits patrimoniaux et les concédants successifs. #
29             # #
30             # À cet égard l'attention de l'utilisateur est attirée sur les risques #
31             # associés au chargement, à  l'utilisation, à  la modification et/ou au #
32             # développement et à la reproduction du logiciel par l'utilisateur étant #
33             # donné sa spécificité de logiciel libre, qui peut le rendre complexe à #
34             # manipuler et qui le réserve donc à des développeurs et des professionnels #
35             # avertis possédant des connaissances informatiques approfondies. Les #
36             # utilisateurs sont donc invités à  charger et tester l'adéquation du #
37             # logiciel à leurs besoins dans des conditions permettant d'assurer la #
38             # sécurité de leurs systêmes et ou de leurs données et, plus généralement, #
39             # à l'utiliser et l'exploiter dans les mêmes conditions de sécurité. #
40             # #
41             # Le fait que vous puissiez accéder à cet en-tête signifie que vous avez #
42             # pris connaissance de la licence CeCILL, et que vous en avez accepté les #
43             # termes. #
44             # #
45             # ------------------------------------------------------------------------- #
46             # #
47             # This file is part of the CracTools which provide several integrated #
48             # pipeline to analyze biological events present in RNA-Seq data. CracTools #
49             # work on a SAM file generated by CRAC and an annotation file in GFF3 format.#
50             # #
51             # This software is governed by the CeCILL license under French law and #
52             # abiding by the rules of distribution of free software. You can use, #
53             # modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL #
54             # license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL #
55             # "http://www.cecill.info". #
56             # #
57             # As a counterpart to the access to the source code and rights to copy, #
58             # modify and redistribute granted by the license, users are provided only #
59             # with a limited warranty and the software's author, the holder of the #
60             # economic rights, and the successive licensors have only limited #
61             # liability. #
62             # #
63             # In this respect, the user's attention is drawn to the risks associated #
64             # with loading, using, modifying and/or developing or reproducing the #
65             # software by the user in light of its specific status of free software, #
66             # that may mean that it is complicated to manipulate, and that also #
67             # therefore means that it is reserved for developers and experienced #
68             # professionals having in-depth computer knowledge. Users are therefore #
69             # encouraged to load and test the software's suitability as regards their #
70             # requirements in conditions enabling the security of their systems and/or #
71             # data to be ensured and, more generally, to use and operate it in the same #
72             # conditions as regards security. #
73             # #
74             # The fact that you are presently reading this means that you have had #
75             # knowledge of the CeCILL license and that you accept its terms. #
76             # #
77             ###############################################################################
78              
79             =head1 NAME
80              
81             CracTools::Const - Constants for the CracTools-core
82              
83             =head1 CONSTANTS
84              
85             =cut
86              
87             package CracTools::Const;
88              
89 1     1   5 use strict;
  1         2  
  1         39  
90 1     1   7 use warnings;
  1         2  
  1         92  
91              
92             =over
93              
94             =item NOT_AVAILABLE
95              
96             =back
97              
98             =cut
99              
100             our $NOT_AVAILABLE = 'N/A';
101              
102             1;