File Coverage

lib/BoutrosLab/TSVStream/Format/AnnovarInput/Human/Fixed.pm
Criterion Covered Total %
statement 15 15 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 5 5 100.0
pod n/a
total 20 20 100.0


line stmt bran cond sub pod time code
1             # safe Perl
2 4     4   53991 use warnings;
  4         7  
  4         119  
3 4     4   13 use strict;
  4         5  
  4         59  
4 4     4   13 use Carp;
  4         7  
  4         273  
5              
6             =head1 NAME
7              
8             BoutrosLab::TSVStream::Format::AnnovarInput::Human::Fixed
9              
10             =cut
11              
12             package BoutrosLab::TSVStream::Format::AnnovarInput::Human::Fixed;
13              
14 4     4   1339 use Moose;
  4         1004146  
  4         25  
15 4     4   20825 use namespace::autoclean;
  4         7  
  4         33  
16              
17             with qw(
18             BoutrosLab::TSVStream::Format::AnnovarInput::Role
19             BoutrosLab::TSVStream::Format::AnnovarInput::Role::Human
20             BoutrosLab::TSVStream::IO::Role::Fixed
21             );
22              
23             __PACKAGE__->meta->make_immutable;
24              
25             =head1 SEE ALSO
26              
27             =over
28              
29             =item BoutrosLab::TSVStream::Format::AnnovarInput::Role
30              
31             for a description of the AnnovarInput attributes; this module supports
32             the BoutrosLab::TSVStream::Format::AnnovarInput::Type::Chr::Human type
33             for the B<chr> attribute.
34              
35             =item BoutrosLab::TSVStream::IO
36              
37             for a description of converting to/from a TSVStream using a reader
38             or a writer. This module only allows for the fixed attributes.
39              
40             =back
41              
42             =head1 AUTHOR
43              
44             John Macdonald - Boutros Lab
45              
46             =head1 ACKNOWLEDGEMENTS
47              
48             Paul Boutros, Phd, PI - Boutros Lab
49              
50             The Ontario Institute for Cancer Research
51              
52             =cut
53              
54             1;
55