File Coverage

blib/lib/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna/GTR.pm
Criterion Covered Total %
statement 7 7 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 3 3 100.0
pod 1 1 100.0
total 11 11 100.0


line stmt bran cond sub pod time code
1             package Bio::Phylo::Models::Substitution::Dna::GTR;
2 1     1   5 use strict;
  1         2  
  1         25  
3 1     1   4 use base 'Bio::Phylo::Models::Substitution::Dna';
  1         2  
  1         96  
4              
5             =head1 NAME
6              
7             Bio::Phylo::Models::Substitution::Dna::GTR - General Time Reversible model
8              
9             =head1 DESCRIPTION
10              
11             See L
12              
13             =head1 METHODS
14              
15             =over
16              
17             =item get_nst
18              
19             Getter for number of transition rate parameters.
20              
21             Type : method
22             Title : get_nst
23             Usage : $model->get_nst;
24             Function: Getter for number of transition rate parameters.
25             Returns : scalar
26             Args : None.
27              
28             =cut
29              
30 1     1 1 2 sub get_nst { 6 }
31              
32             =back
33              
34             =head1 SEE ALSO
35              
36             There is a mailing list at L
37             for any user or developer questions and discussions.
38              
39             =over
40              
41             =item L
42              
43             Also see the manual: L and L.
44              
45             =back
46              
47             =head1 CITATION
48              
49             If you use Bio::Phylo in published research, please cite it:
50              
51             B, B, B, B
52             and B, 2011. Bio::Phylo - phyloinformatic analysis using Perl.
53             I B<12>:63.
54             L
55              
56             =cut
57              
58             1;