File Coverage

blib/lib/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Sanger.pm
Criterion Covered Total %
statement 6 6 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 2 2 100.0
pod n/a
total 8 8 100.0


line stmt bran cond sub pod time code
1             package Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Sanger;
2 1     1   5 use strict;
  1         2  
  1         27  
3 1     1   4 use base 'Bio::Phylo::Matrices::Datatype';
  1         2  
  1         156  
4             our ( $LOOKUP, $MISSING, $GAP );
5              
6             =head1 NAME
7              
8             Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Sanger - Validator subclass,
9             no serviceable parts inside
10              
11             =head1 DESCRIPTION
12              
13             The Bio::Phylo::Matrices::Datatype::* classes are used to validate data
14             contained by L and L
15             objects.
16              
17             =cut
18              
19             # podinherit_insert_token
20              
21             =head1 SEE ALSO
22              
23             There is a mailing list at L
24             for any user or developer questions and discussions.
25              
26             =over
27              
28             =item L
29              
30             This class subclasses L.
31              
32             =item L
33              
34             Also see the manual: L and L.
35              
36             =back
37              
38             =head1 CITATION
39              
40             If you use Bio::Phylo in published research, please cite it:
41              
42             B, B, B, B
43             and B, 2011. Bio::Phylo - phyloinformatic analysis using Perl.
44             I B<12>:63.
45             L
46              
47             =cut
48              
49             $LOOKUP = { map { chr($_) => [ $_ - 33 ] } 33 .. 126 };
50             $MISSING = '?';
51             $GAP = '-';
52             1;