File Coverage

lib/App/Sandy/Role/Template/Fastq.pm
Criterion Covered Total %
statement 6 6 100.0
branch n/a
condition n/a
subroutine 2 2 100.0
pod 0 1 0.0
total 8 9 88.8


line stmt bran cond sub pod time code
1             package App::Sandy::Role::Template::Fastq;
2             # ABSTRACT: Fastq template role
3              
4 6     6   4244 use App::Sandy::Base 'role';
  6         19  
  6         41  
5              
6             our $VERSION = '0.24'; # VERSION
7              
8             sub with_fastq_template {
9 9161     9161 0 23145 my ($self, $seqid_ref, $read_ref, $quality_ref) = @_;
10 9161         31381 my $fastq = "\@$$seqid_ref\n$$read_ref\n+\n$$quality_ref\n";
11 9161         70135 return \$fastq;
12             }
13              
14             __END__
15              
16             =pod
17              
18             =encoding UTF-8
19              
20             =head1 NAME
21              
22             App::Sandy::Role::Template::Fastq - Fastq template role
23              
24             =head1 VERSION
25              
26             version 0.24
27              
28             =head1 AUTHORS
29              
30             =over 4
31              
32             =item *
33              
34             Thiago L. A. Miller <tmiller@mochsl.org.br>
35              
36             =item *
37              
38             J. Leonel Buzzo <lbuzzo@mochsl.org.br>
39              
40             =item *
41              
42             Felipe R. C. dos Santos <fsantos@mochsl.org.br>
43              
44             =item *
45              
46             Helena B. Conceição <hconceicao@mochsl.org.br>
47              
48             =item *
49              
50             Rodrigo Barreiro <rbarreiro@mochsl.org.br>
51              
52             =item *
53              
54             Gabriela Guardia <gguardia@mochsl.org.br>
55              
56             =item *
57              
58             Fernanda Orpinelli <forpinelli@mochsl.org.br>
59              
60             =item *
61              
62             Rafael Mercuri <rmercuri@mochsl.org.br>
63              
64             =item *
65              
66             Rodrigo Barreiro <rbarreiro@mochsl.org.br>
67              
68             =item *
69              
70             Pedro A. F. Galante <pgalante@mochsl.org.br>
71              
72             =back
73              
74             =head1 COPYRIGHT AND LICENSE
75              
76             This software is Copyright (c) 2023 by Teaching and Research Institute from Sírio-Libanês Hospital.
77              
78             This is free software, licensed under:
79              
80             The GNU General Public License, Version 3, June 2007
81              
82             =cut